Yamaha R3 được biết là mẫu Sport city phục vụ cho các tín đồ yêu thích PKL và muốn trải nghiệm khi chưa đủ tự tin cưỡi những em 1000 phân khối, với ngoại hình ảnh hưởng DNA từ đàn anh R1, và bản độ dưới đây khá đặc sắc với ý tưởng chế mủ cũng như lên bộ tem từ siêu mô tô Ý MV Agusta F4 RC, và bản độ được gọi nôm na với cái tên hoàn toàn mới là R3M AMG V4. Yamaha R3 bản độ khác biệt mang tên R3M AMG V4. Dựa trên thiết kế hiện tại từ nét thể thao ảnh hưởng chi tiết vay mượn đàn anh R1, Yamaha R3 trong bản độ được chủ nhân sửa đổi dàn đầu trước với 2 ngàm trước chĩa ra như Superbike Ninja H2 tạo lực ép xuống mặt đường tốt hơn. Đèn pha tạo điểm nhấn với decal xám khói ngầu lòi, đầu xe thể hiện logo nổi tiếng của Sportbike BMW S1000RR. Dễ thấy hệ thống phuộc trước tiêu chuẩn dạng ống lồng được mod lại sao cho giống Upside Down từ các anh lớn khá ấn tượng. Dàn áo được ngụy trang theo phong cách sắc cờ Ý với 3 màu tiêu chuẩn trắng xanh đỏ dựa theo đàn anh MV Agusta F4 RC. Vị trí bình xăng cũng được cách điệu với ốp bình xăng tương tự đàn anh R1, hệ thống ống xả đã có phần thay đổi với trang bị ống xả Yoshimura đem lại cảm nhận âm thanh được tốt hơn và tràn trề uy lực. Yamaha R3 sử dụng khối động cơ DOHC, 2 xy-lanh thẳng hàng, dung tích 321 phân khối và hộp số 6 cấp. Động cơ này sản sinh công suất tối đa 41 mã lực tại vòng tua máy 10.750 v/ph và mô-men xoắn cực đại 29,6 Nm tại vòng tua máy 9.000 v/ph. Hệ thống treo sau đã được thay đổi monoshock Ohlins bình dầu rời đem lại độ nhún êm ái hơn khá nhiều so với trang bị tiêu chuẩn. Ý tưởng khá hấp dẫn dựa trên nguyên bản Yamaha R3.
