Phiên bản đặc biệt 60 năm là phiên bản mới nhất của chiếc superbike Yamaha R1 2015 nhằm kỷ niệm sinh nhật lần thứ 60 trong làng mô tô thế giới với dàn áo thể thao đầy nổi bật trong 3 màu sắc vàng, đen và trắng. Phiên bản đặc biệt này càng trở nên nổi bật hơn khi được độ chính hãng với những option cực chất được trưng bày trong một sự kiện triển lãm. Yamaha R1 2015 phiên bản đặc biệt 60 năm độ chính hãng cực chất Yamaha R1 phiên bản kỷ niệm 60 năm vẫn sở hữu động cơ Crossplane 4 xi-lanh thẳng hàng, DOHC, làm mát bằng chất lỏng, dung tích 998 phân khối, công suất tối đa 200 mã lực tại 13.500 vòng/phút và mô-men xoắn cực đại 112,4 Nm tại 11.500 vòng/phút. Mỗi xi-lanh có 2 kim phun nhiên liệu khác nhau. Yamaha R1 2015 còn có thanh truyền bằng titan, nhẹ hơn khoảng 60% so với loại làm từ thép. Có lẻ vẫn chưa hài lòng với những nâng cấp mặc định từ phiên bản đặc biệt 60 năm trên Yamaha R1 như hệ thống ống xả hàng hiệu Akrapovic hay bộ mâm được sơn màu vàng kim loại, một nhóm phát triển của Yamaha đã quyết định trang bị thêm cho phiên bản độ này với cây pô Akrapovic uy lực hơn, bộ mâm 5 cây siêu nhẹ, cặp vỏ Dunlop chuyên dành cho xe đua, một vài chi tiết được ốp fiber carbon đầy tinh tế, cùng cặp phuộc Ohlins hàng hiệu... Dàn đầu xe trở nên ấn tượng với số hiệu 94 trên nền fiber carbon Cặp phuộc trước Ohlins FGR có giá trị khá cao cùng cặp heo Brembo hàng hiệu Phuộc sau Ohlins, bộ sên dĩa từ RK cùng vài chi tiết được ốp fiber carbon đầy tinh tế Ngoài ra xe còn được trang bị ống xả Akrapovic cao cấp đầy uy lực thường dùng cho các giải đua xe.